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                轉錄調控測序

                Transcriptional regulatory sequencing

                轉錄組測序

                轉錄組測序(mRNA-Seq)是使用高通量測序技術,在給定時刻從一個基因組中,揭示 RNA 的存在和數量的一個快照的技術,為生命科學研究提供了全新的角度,可用於預測基因結構、可變剪切和其他轉錄修飾,並可定量測定每個轉錄本在生長過程中和不同條件下表達水平的變化。

                技術路線

                技術路線

                服務內容 & 樣本要求

                項目周期

                項目周期

                30天(自然日)
                測序平臺及策略

                測序平臺及策略

                HiSeq X ten PE150
                NovaSeq 6000
                測序數據量

                測序數據量

                6G/8G/10G/12G
                樣本類型 樣品量需求 樣品純度需求
                動物/植物樣本 總量≥1μg,濃度≥50ng/μL OD260/280≥1.8,RIN ≥7,28S/18S≥1.0

                轉錄組測序案例解析

                PTPRZ1-MET 融合基因在繼發性膠質母細胞瘤中的表達(Genome Research)

                該研究利用轉錄組測序技術,對272個WHO二級、三級和四級膠質瘤的轉錄本融合進行分類。發現融合基因在惡性膠質瘤、典型的膠質瘤亞型以及放射/替莫唑胺治療的膠質瘤中更為常見。67個幀內融合轉錄子,包括3個復發的融合轉錄子:FGFR3-TACC3、RNF213-SLC26A11和PTPRZ1-MET(ZM)。研究描繪了膠質瘤進展過程中的RNA變化。

                轉錄組測序案例解析

                參考文獻:

                Bao Z S, Chen H M, Yang M Y, et al. RNA-seq of 272 gliomas revealed a novel, recurrent PTPRZ1-MET fusion transcript in secondary glioblastomas.[J]. Genome Research, 2014, 24(11):1765.

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